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        机构用户解决方案

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        技术服务信息

        当前位置:首页 > 单细胞测序解决方案 > 单细胞分选系统

         
        近几年,单细胞测序是比较热门的研究方向。但是,理想很丰满,现实却很骨感。要做好单细胞测序,还要面临单细胞获取困难、起始量低、人工操作误差大的问题。
         
        Takara推出单细胞测序的技术专题,从单细胞获取、到测序文库制备 ,“手把手”告诉大家怎么选择,尽可能使大家避开“雷区”,轻松得到正确的单细胞分析结果。同时这个专题覆盖了单细胞转录组、单细胞全基因测序,单细胞免疫组库分析,帮助大家根据自己的需要更好的进行选择。
         
        ■ 怎么又多又快的获得想要的单细胞?
         
        ICELL8® cx Single-Cell System
         
        获得单细胞有很多方法,常见的有手动挑选、激光显微切割、流式细胞分选等。但这些较为传统的方法,也因为繁琐、通量低、细胞活性差等缺点局限了研究人员对单细胞研究的深入探讨。ICELL8®cx Single-Cell System能够对大部分细胞种类,简单、快速、有效挑选出1,200~1,500个活的单细胞。并可根据不同的研究方向,在该系统上直接实现诸如Human TCR a/b profiling、全长转录组等测序文库的构建,打破了传统方法的局限性。
         
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        ■ 怎么保证低起始量下获得高品质文库?
         
        「当您做单细胞转录组研究时」
        低通量单细胞mRNA分析:SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing
        NGS技术的出现,使得对RNA的研究变得更为容易,但是对于单细胞进行转录组文库分析,如何获得高质量的全长cDNA一直是很具有挑战性的。Takara公司拥有核心专利SMART技术,在2011年即推出了可以高灵敏度在单细胞水平上分析差异表达、融合基因、可变剪接,并提供全长信息的cDNA制备试剂。而升级的SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing在原有基础上引入LNA技术,提升了模板转换效率,可以检测到比以往更多的基因。
        流程示意图
         
        较高通量单细胞mRNA分析:SMART-Seq® HT Kit
        SMART-Seq® HT Kit旨在以较高通量的方式从1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA制备高品质的全长cDNA。通过整合为一步的RT和PCR反应,在4小时内便可获得双链cDNA??!
         
        高灵敏度的单细胞全长mRNA分析:SMART-Seq® Single Cell Kit
        SMART-Seq® Single Cell Kit基于SMART-Seq® 技术进行了优化改良,针对微量核酸样品具有更高的灵敏度和再现性,适用于单细胞和细胞核的RNA-Seq分析??梢源右阎哂械蚏NA含量的单细胞(例如PBMCs)直接生成高质量的全长cDNA,性能远远超过许多现有单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2。同时,高度灵活的工作流程可与自动化微量移液设备兼容。
         
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        单细胞总RNA分析:SMART-Seq® Stranded Kit
        在单细胞水平,想要满足编码RNA和非编码RNA在内的全部转录组分析,SMART-Seq® Stranded Kit是非常不错的选择。它足够灵敏,可以单细胞或微量RNA起始;它足够准确,可以保留链来源信息;它足够包容,降解样本,也能获得很好的转录组测序文库!
         
        「当您做单细胞全基因组研究时」
        单细胞全基因组扩增:PicoPLEX® Single Cell WGA Kit v3
        对于单细胞全基因组的研究,仅含有皮克级DNA的单细胞来说,量少而难以直接进行文库构建。因此需要先对单细胞中的DNA进行高质量的扩增。PicoPLEX® Single Cell WGA Kit v3采用“随机引物引发线性扩增”+“发夹结构”在2.5小时内,仅需三步即可实现高再现性的全基因组扩增。作为PicoPLEX® WGA Kit系列中的全新一代产品,PicoPLEX® WGA Kit v3进一步优化了DNA聚合酶、扩增引物、操作流程,拥有更好的CNV检测分辨率,同时具备 高效的SNV检测能力,满足不同检测需求。PicoPLEX® WGA Kit系列产品在全球被IVF行业供应商信赖,并用于胚胎植入前遗传学筛查和诊断(PGS/PGD)。
        流程示意图
         
        单细胞DNA文库构建:PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit
        由于NGS技术的迅速发展,使得对单细胞全基因组研究更为广泛和成熟。不过目前对于单细胞全基因组的文库构建,更多的方法是先进行单细胞全基因组扩增,再进行DNA文库构建两步走的方式,整个操作复杂,稍有不慎就很可能需要重头再来,让人头痛不已。PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit,这款试剂盒将单细胞全基因组扩增和DNA文库构建两步整合在一起,只需四步三小时,便可完成单细胞到全基因组测序文库的华丽变身!
         
        「当您做单细胞免疫组库研究时」
        目前,对T细胞受体(TCR)的常用方法是对bulk细胞的TCR CDR3区域进行测序。而采用SMARTer® Human scTCR a/b Profiling Kit构建TCR文库的优势在于:可以对单个T细胞进行分析,确定T细胞群内特定的alpha-beta 受体链配对信息。这也是以bulk细胞为依托的传统研究手段所无法比拟的。
        单细胞TCR测序
         
        ■ 怎么减少手动操作所带来的偏差?
         
        Apollo Library Prep System
        对于操作精度要求很高的单细胞层面分析,就算采用了优异的单细胞文库构建试剂,操作也很熟练,但在对多个样本进行同时分析时,难免会因为长时间手动操作所带来的偏差,使得样本间单细胞分析结果的准确性、一致性有所折扣。 为此,Takara公司推出的Apollo Library Prep System,在配套了SMART-Seq v4单细胞cDNA制备Kit后,可高效、可靠、自动化制备多达96个单细胞样品的cDNA用于后续的NGS分析,降低了手动操作时间,减少了实验误差,获得有效的结果。
        Apollo Library Prep System
         
         
         

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